Je zakladatelem Nadačního fondu proti korupci. Založil Institute H21, Nadační fond Karla Janečka na podporu vědy a výzkumu (dnes Nadační fond Neuron na podporu vědy), Nadační fond pomoci a platformu Znesnáze21, Nadaci Karla Janečka a nadaci Science 21.

Založil šest nadací, skrze něž podporuje projekty, které jsou zaměřené na vzdělávání dětí, vědu, aktivní občanskou společnost, kulturu, protikorupční aktivity, pomoc potřebným, sport či společensky prospěšné inovace. Od roku 2011 věnoval více než 777 milionů Kč.

Je spoluautorem strategické matematické hry Mathesso, která funguje na bázi pexesa s čísly a barvami (nadace Science 21) a významně investoval do rozvoje hry Abaku, která se dnes používá pro výuku ve více než 600 školách v ČR a získala mezinárodní ocenění „Academics’ Choice 2022 Brain Toy Winner Award for Mind-Building Excellence“, což je prestižní záruka kvality ve vzdělávání, vyhrazená jen pro ty nejlepší hračky a média rozvíjející myšlení.